Der Wissenschaftliche Beirat berät den Stiftungsrat und das Direktorium in wissenschaftlichen und technischen Fragen. Ihm obliegt die eigenverantwortliche Bewertung der wissenschaftlich-technischen Ergebnisse. Der Wissenschaftliche Beirat fördert zudem Kooperationen mit adäquaten Forschungseinrichtungen des In- und Auslandes.

Die Mitglieder des Wissenschaftlichen Beirates werden vom Stiftungsrat im Einvernehmen mit der Geschäftsführung für jeweils vier Jahre ernannt. Eine einmalige Wiederberufung in Folge ist möglich.

Die detaillierten Aufgaben des Wissenschaftlichen Beirates finden sich in §12 der Satzung des Instituts.

Aktuelle Mitglieder des Wissenschaftlichen Beirates sind:

• Prof. Dr. Andreas Weber, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf (Vorsitzender)
• Prof. Dr. Steffen Abel, Leibniz-Institut für Pflanzenbiochemie, Halle
• Dr. Alison Bentley, Australian National University, Canberra, Australia
• Prof. Dr. Dr. Kirsten Bomblies, ETH Zürich,Schweiz
• Prof. Dr. Svend Christensen, University of Copenhagen,Dänemark
• Dr. Janine Felden, Alfred-Wegener-Institut, Bremerhaven
• Dr. Karin Herbers, BASF Vegetable Seeds, Davis, USA
• Prof. Dr. Maria von Korff Schmising, Universität Düsseldorf
• Prof. Dr. Klaus Mayer, Helmholtz Zentrum München, Pflanzengenome und Systembiologie
• Dr. Ortrun Mittelsten Scheid, Gregor Mendel Institut für Molekulare Pflanzenbiologie GmbH, Wien
• Prof. Dr. Cristobal Uauy, John Innes Centre, Norwich, Großbritannien