Leitung: Prof. Dr. Ivo Grosse
Plant Data Warehouse
Publikationen
Schallau A, Kakhovskaya I, Tewes A, Czihal A, Tiedemann J, Mohr M, Grosse I, Manteuffel R, Bäumlein H:
Phylogenetic footprints in fern spore- and seed-specific gene promoters. Plant J. 53 (2008) 414-424. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03354.x
Grau J, Keilwagen J, Grosse I, Posch S:
On the relevance of model orders to discriminative learning of Markov models. In: Hinneburg A (Ed.): LWA 2007 : Lernen, Wissen, Adaption, Halle, September 2007; workshop proceedings. Halle/S.: Martin-Luther-Univ. Halle-Wittenberg, Inst. for Informatics, Databases and Information Systems (2007) ISBN 978-3-86010-907-6, 61-66.
Grau J, Keilwagen J, Kel A, Grosse I, Posch S:
Supervised posteriors for DNA-motif classification. In: Falter C, Schliep A, Selbig J, Vingron M, Walther D (Eds.): German Conference on Bioinformatics, GCB 2007: 26.-28.09.2007 in Potsdam, Germany, proceedings (Series: Lecture notes in informatics, Vol. 115) Bonn: Ges. für Informatik (2007) ISBN 978-3-88579-209-3, 123-134.
Keilwagen J, Grau J, Posch S, Grosse I:
Recognition of splice sites using maximum conditional likelihood. In: Hinneburg A (Ed.): LWA 2007: Lernen, Wissen, Adaption, Halle, September 2007; workshop proceedings. Halle/S.: Martin-Luther-Univ. Halle-Wittenberg, Inst. for Informatics, Databases and Information Systems (2007) ISBN 978-3-86010-907-6, 67-72.
Keller E R J, Funke T:
Die Knoblauch-Kernkollektion des IPK - IPK’s Core Collection of Garlic. pgrc-35.ipk-gatersleben.de/apps/gcc/index.htm (2007).
Laurent V, Devaux P, Thiel T, Viard F, Mielordt S, Touzet P, Quillet M C:
Comparative effectiveness of sugar beet microsatellite markers isolated from genomic libraries and GenBank ESTs to map the sugar beet genome. Theor. Appl. Genet. 115 (2007) 793-805. https://dx.doi.org/10.1007/s00122-007-0609-y
Mauritz J:
Erkennung von DNA-Bindungsstellen mittels Maximum Conditional Likelihood. (Diploma Thesis) Halle/S., Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Institut für Informatik (2007) 111 pp.
Mönke G, Linh T M, Conrad U, Hähnel U, Altschmied L, Mohr M, Grosse I, Vorwieger A, Bäumlein H, Weisshaar B, Viehöver P:
GABI-ARABIDO-SEED: Wie steuern Transkriptionsfaktoren die Samenentwicklung bei Pflanzen? GenomXPress Sonderausgabe März (2007) 16.
Podobnik B, Shao J, Dokholyan N V, Zlatic V, Stanley H E, Grosse I:
Similarity and dissimilarity in correlations of genomic DNA. Physica A 373 (2007) 497-502. https://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2006.05.041
Scholz U, Künne C, Lange M, Miehe H, Funke T:
IPK Crop EST Database: CR-EST (Version 1.5). pgrc.ipk-gatersleben.de/cr-est/ (2007).
Stein N, Prasad M, Scholz U, Thiel T, Zhang H, Wolf M, Kota R, Varshney R K, Perovic D, Grosse I, Graner A:
A 1,000-loci transcript map of the barley genome: new anchoring points for integrative grass genomics. Theor. Appl. Genet. 114 (2007) 823-839. https://dx.doi.org/10.1007/s00122-006-0480-2
Weise S, Harrer S, Grosse I, Knüpffer H, Willner E:
The European Poa Database (EPDB). Plant Genet. Resour. Newsl. 150 (2007) 64-70.
Funke T, Weise S, Knüpffer H, Grosse I:
Ein neues Gesicht für die Europäische Gerstendatenbank (EBDB). Vortr. Pflanzenzücht. 70 (2006) 79-80.
Grau J, Ben-Gal I, Posch S, Grosse I:
VOMBAT: prediction of transcription factor binding sites using variable order Bayesian trees. Nucleic Acids Res. 34 (2006) W529-W533. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkl212
Große I, Funke T, Kuenne C, Neumannn S, Stephanik A, Thiel T, Weise S:
Integrative Datenanalyse mit dem Plant Data Warehouse. Vortr. Pflanzenzücht. 70 (2006) 50-53.
Mielordt S, Grosse I, Kleffe J:
Data structures for genome annotation, alternative splicing, and validation. Data Integration in the Life Sciences-Proceedings. Lect. Notes Comput. Sci 4075 (2006) 114-123. https://dx.doi.org/10.1007/11799511_11
Podobnik B, Fu D F, Jagric T, Grosse I, Stanley H E:
Fractionally integrated process for transition economics. Physica A 362 (2006) 465-470. https://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2005.09.051
Stephanik A, Bachmann H, Funke T, Kuenne C, Langer E, Thiel T, Weise S, Große I:
Das Plant Bioinformatics Portal. Vortr. Pflanzenzücht. 70 (2006) 81-83.
Varshney R K, Grosse I, Hähnel U, Siefken R, Prasad M, Stein N, Langridge P, Altschmied L, Graner A:
Genetic mapping and BAC assignment of EST-derived SSR markers shows non-uniform distribution of genes in the barley genome. Theor. Appl. Genet. 113 (2006) 239-250. https://dx.doi.org/10.1007/s00122-006-0289-z
Weise S, Grosse I, Klukas C, Koschützki D, Scholz U, Schreiber F, Junker B H:
Meta-All: a system for managing metabolic pathway information. BMC Bioinformatics 7 (2006) 465. https://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-7-465
Weise S, Knüpffer H, Vorwald J, Scholz U, Grosse I:
Integration von phänotypischen Daten in das Plant Data Warehouse. Vortr. Pflanzenzücht. 70 (2006) 84-86.