Genregulation

Forschungsgebiete

Leitung: Dr. habil. Helmut Bäumlein

Im Mittelpunkt unseres Interesses steht die molekulare Analyse genetischer und epigenetischer Prozesse, die der sexuellen und asexuellen Reproduktion zu Grunde liegen. Dazu arbeiten wir an der sexuellen Modellpflanze Arabidopsis, an parthenogenetischen Linien des Weizen `Salmon` Systems sowie an den Apomikten Hypericum und Boechera.

Pflanzliche Entwicklung ist durch die alternierende Folge zweier Generationen gekennzeichnet, dem Gameten-bildenden Gametophyten und dem Sporen-bildenden Sporophyten. Meiotische Reduktion diploider Sporen führt zur Bildung weiblicher und männlicher Gameten im weiblichen (Embryosack) bzw. männlichen (Pollen) Gametophyten. Bei der Befruchtung fusionieren weibliche und männliche Gameten (Eizelle bzw. Spermazelle) zur Zygote, aus der ein diploider sporophytischer Embryo entsteht. Charakteristisches Merkmal der Blütenpflanzen ist die doppelte Befruchtung. Dabei wird ein zweiter weiblicher Gamet, die homo-diploide Zentralzelle, durch eine weitere Spermazelle befruchtet. Das triploide Befruchtungsprodukt entwickelt sich zum Endosperm, ein der Ernährung des Embryos dienendes Nährgewebe. Während der anschließenden Samenreifung werden Speicherstoffe deponiert; es kommt zur Ausprägung von Trocknungstoleranz und Dormanz. Aus dem nach einer Ruhephase keimenden Samen entsteht der bei höheren Pflanzen bezüglich der Biomasse stark dominierende neue Sporophyt.

Die beschriebene sexuelle Reproduktion ist charakteristisch für die meisten Pflanzen. Einige Pflanzenarten vermehren sich jedoch durch asexuelle Samenbildung, ein Prozess, der als Apomixis bezeichnet wird. Durch Apomeiose und Parthenogenese werden dabei Meiose bzw. Befruchtung vermieden bzw. umgangen, was zu genetischen Klonen der Mutterpflanze führt. Die molekulare Analyse dieser sexuellen bzw. asexuellen Entwicklungsprozesse ist einerseits ein faszinierender Aspekt grundlegender Entwicklungsbiologie, andererseits ein seit Langem angestrebtes Problem der biotechnologischen Anwendung, insbesondere für die Produktion von Nahrungsmitteln sowie die Fixierung von Hybrideffekten (d.h. Heterosis) durch Apomixis.

Publikationen

Autor
Titel
2019

Galla G, Siena L A, Ortiz J P A, Bäumlein H, Barcaccia G, Pessino S C, Bellucci M, Pupilli F:

A portion of the apomixis locus of Paspalum simplex is microsyntenic with an unstable chromosome segment highly conserved among Poaceae. Sci. Rep. 9 (2019) 3271. https://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-39649-6

Rizzo P, Altschmied L, Stark P, Rutten T, Guendel A, Scharfenberg S, Franke K, Baeumlein H, Wessjohann L, Koch M, Borisjuk L, Sharbel T F:

Discovery of key regulators of dark glands development and hypericin biosynthesis in St. Johns wort (Hypericum perforatum). Plant Biotechnol. J. 17 (2019) 2299-2312. https://dx.doi.org/10.1111/pbi.13141

Tedeschi F, Rizzo P, Huong B, Czihal A, Rutten T, Altschmied L, Scharfenberg S, Grosse I, Becker C, Weigel D, Bäumlein H, Kuhlmann M:

EFFECTOR OF TRANSCRIPTION factors are novel plant-specific regulators associated with genomic DNA methylation in Arabidopsis. New Phytol. 221 (2019) 261-278. https://dx.doi.org/10.1111/nph.15439

2017

Tedeschi F, Rizzo P, Rutten T, Altschmied L, Bäumlein H:

RWP-RK domain-containing transcription factors control cell differentiation during female gametophyte development in Arabidopsis. New Phytol. 213 (2017) 1909–1924. https://dx.doi.org/10.1111/nph.14293

2016

Rizzo P:

Novel insights on female gametophyte development in the apomictic model species Boechera spp. and Hypericum spp. (PhD Thesis) Halle/S., Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Naturwissenschaftliche Fakultät I Biowissenschaften (2016) 182 pp.

Shah J N, Kirioukhova O, Pawar P, Tayyab M, Mateo J L, Johnston A J:

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2015

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RKD-Transkriptionsfaktoren als zentrale Regulatoren der Gametophyt-Entwicklung bei Arabidopsis thaliana. (Master Thesis) Magdeburg, Otto-von-Guericke-Universität (2015) 61 pp.

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2014

Harshavardhan V T, Van Son L, Seiler C, Junker A, Weigelt-Fischer K, Klukas C, Altmann T, Sreenivasulu N, Bäumlein H, Kuhlmann M:

AtRD22 and AtUSPL1, members of the plant-specific BURP domain family involved in Arabidopsis thaliana drought tolerance. PLoS One 9 (2014) e110065. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0110065

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Multifunctionality of the LEC1 transcription factor during plant development. Plant Signal. Behav. 7 (2012) 1718-1720. https://dx.doi.org/10.4161/psb.22365

Junker A, Mönke G, Rutten T, Keilwagen J, Seifert M, Thi T M, Renou J P, Balzergue S, Viehover P, Hähnel U, Ludwig-Müller J, Altschmied L, Conrad U, Weisshaar B, Bäumlein H:

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Mönke G, Seifert M, Keilwagen J, Mohr M, Grosse I, Hähnel U, Junker A, Weisshaar B, Conrad U, Bäumlein H, Altschmied L:

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2011

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The cytohistological basis of apospory in Hypericum perforatum L. Sex. Plant Reprod. 24 (2011) 47-61. https://dx.doi.org/10.1007/s00497-010-0147-7

Heckmann S, Lermontova I, Berckmans B, De Veylder L, Bäumlein H, Schubert I:

The E2F transcription factor family regulates CENH3 expression in Arabidopsis thaliana. Plant J. 68 (2011) 646-656. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04715.x

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Female gametophytic cell specification and seed development require the function of the putative Arabidopsis INCENP ortholog WYRD. Development 138 (2011) 3409-3420. https://dx.doi.org/10.1242/dev.060384

Kőszegi D, Johnston A J, Rutten T, Czihal A, Altschmied L, Kumlehn J, Wust S E, Kirioukhova O, Gheyselinck J, Grossniklaus U, Bäumlein H:

Members of the RKD transcription factor family induce an egg cell-like gene expression program. Plant J. 67 (2011) 280-291. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04592.x

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The RETINOBLASTOMA pathway controls reproductive development and genome integrity in Arabidopsis. (Bachelor Thesis) Halle/S., Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (2011) 43 pp.

Lermontova I, Koroleva O, Rutten T, Fuchs J, Schubert V, Moraes I, Köszegi D, Schubert I:

Knockdown of CENH3 in Arabidopsis reduces mitotic divisions and causes sterility by disturbed meiotic chromosome segregation. Plant J. 68 (2011) 40-50. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04664.x

Mildner M:

Funktionelle Charakterisierung von Eizell-aktiven RKD-Faktoren in Arabidopsis thaliana. (PhD Thesis) Halle/S., Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (2011) 128 pp.

2010

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TRAUCO, a Trithorax-group gene homologue, is required for early embryogenesis in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot. 61 (2010) 1215-1224. https://dx.doi.org/10.1093/jxb/erp396

Johnston A J, Kirioukhova O, Barrell P J, Rutten T, Moore J M, Baskar R, Grossniklaus U, Gruissem W:

Dosage-sensitive function of RETINOBLASTOMA RELATED and convergent epigenetic control are required during the Arabidopsis life cycle. PLoS Genet. 6 (2010) e1000988. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1000988

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Schallau A, Arzenton F, Johnston A J, Hähnel U, Köszegi D, Blattner F, Altschmied L, Haberer G, Barcaccia G, Bäumlein H:

Identification and genetic analysis of the APOSPORY locus in Hypericum perforatum L. Plant J. 62 (2010) 773-784. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2010.04188.x

2009

Junker A:

Characterization of the LEAFY COTELYDON1 regulon: Transcription factor-controlled hormone cross-talk during somatic and zygotic embryogenesis. (PhD Thesis) Halle/S., Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (2009) 171 pp.

Van Son L, Tiedemann J, Rutten T, Hillmer S, Hinz G, Zank T, Manteuffel R, Bäumlein H:

The BURP domain protein AtUSPL1 of Arabidopsis thaliana is destined to the protein storage vacuoles and overexpression of the cognate gene distorts seed development. Plant Mol. Biol. 71 (2009) 319-329. https://dx.doi.org/10.1007/s11103-009-9526-6

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Ivanov R, Tiedemann J, Czihal A, Schallau A, Diep L, Mock H-P, Claus B, Tewes A, Bäumlein H:

EFFECTOR OF TRANSCRIPTION2 is involved in xylem differentiation and includes a functional DNA single strand cutting domain. Dev. Biol. 313 (2008) 93-106. https://dx.doi.org/10.1016/j.ydbio.2007.09.061

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Schallau A, Kakhovskaya I, Tewes A, Czihal A, Tiedemann J, Mohr M, Grosse I, Manteuffel R, Bäumlein H:

Phylogenetic footprints in fern spore- and seed-specific gene promoters. Plant J. 53 (2008) 414-424. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2007.03354.x

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Tiedemann J, Rutten T, Mönke G, Vorwieger A, Rolletschek H, Meissner D, Milkowski C, Petereck S, Mock H-P, Zank T, Bäumlein H:

Dissection of a complex seed phenotype: novel insights of FUSCA3 regulated developmental processes. Dev. Biol. 317 (2008) 1-12. https://dx.doi.org/10.1016/j.ydbio.2008.01.034

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Kotak S, Vierling E, Bäumlein H, von Koskull-Döring P:

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Matzk F, Prodanovic S, Czihal A, Tiedemann J, Arzenton F, Blattner F R, Kumlehn J, Altschmied L, Schubert I, Johnston A, Grossniklaus U, Bäumlein H:

Genetic control of apomixis: preliminary lessons from Poa, Hypericum and wheat egg cells. In: Hörandl E, Grossniklaus U, van Dijk P J, Sharbel T F (Eds.): Apomixis: evolution, mechanisms and perspectives. (Series: Regnum vegetabile, Vol. 147) Rugell, Liechtenstein: Gantner (2007) ISBN 978-3-906166-60-5, 159-166.

Mönke G, Linh T M, Conrad U, Hähnel U, Altschmied L, Mohr M, Grosse I, Vorwieger A, Bäumlein H, Weisshaar B, Viehöver P:

GABI-ARABIDO-SEED: Wie steuern Transkriptionsfaktoren die Samenentwicklung bei Pflanzen? GenomXPress Sonderausgabe März (2007) 16.

Perovic D, Tiffin P, Douchkov D, Bäumlein H, Graner A:

An integrated approach for the comparative analysis of a multigene family: The nicotianamine synthase genes of barley. Funct. Integr. Genomics 7 (2007) 169-179. https://dx.doi.org/10.1007/s10142-006-0040-5

Vorwieger A, Gryczka C, Czihal A, Douchkov D, Tiedemann J, Mock H-P, Jakoby M, Weisshaar B, Saalbach I, Bäumlein H:

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Wang H Y, Klatte M, Jakoby M, Bäumlein H, Weisshaar B, Bauer P:

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2006

Zimmermann G, Bäumlein H, Mock H-P, Himmelbach A, Schweizer P:

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